《方案》明确，北京全国科技创新中心的定位是全球科技创新引领者、高端经济增长极、创新人才首选地、文化创新先行区和生态建设示范城。提出到2030年，全国科技创新中心的核心功能更加优化，为我国跻身创新型国家前列提供有力支撑。

《方案》提出了加强北京全国科技创新中心建设的重点任务。一是强化原始创新，打造世界知名科学中心。二是加快技术创新，构建“高精尖”经济结构。三是推进协同创新，培育世界级创新型城市群。四是坚持开放创新，构筑开放创新高地。五是推进全面创新改革，优化创新创业环境。

国务院发展研究中心技术经济部部长吕薇认为，中国各地区域发展不均衡，要素布局、创新能力相差大，不可能齐步走，因此必须因地制宜营造有利于创新的环境，打造各具特色的区域创新体系。而推动北京、上海等优势地区建成具有国际影响力的科技创新中心的部署是区域创新体系的第一个层次。